נדרשים מדידות אתרים ובניית יסודות. אתר ההתקנה צריך להיות שטוח, יציב, ובעל מספיק מקום כדי לענות על צורכי התקנת הציוד, התפעול והתחזוקה. הבסיס עשוי בדרך כלל מבטון יצוק, מה שמבטיח שכושר נשיאת העומס שלו עומד בדרישות המשקל של המשרפה וציוד העזר. לפני ההתקנה, יש לבדוק את מפלס הקרקע ואת מיקומי הממשק השמורים לציוד כדי לוודא שצינורות, תעלות אוויר, ספקי כוח ומערכות בקרה ממוקמים כראוי.
הגוף הראשי, תא הבעירה, מערכת הפליטה, מערכות העזר (כגון מאווררים ומערכות קירור מים) ומערכת הבקרה של משרפת הפסולת מורכבים לפי שרטוטי התכנון. ציוד גדול ממוקם בדרך כלל באמצעות ציוד הרמה, המבטיח שהריתוך, חיבורי הברגים והתומכים יציבים ואמינים. במהלך ההתקנה, יש לשים לב לאיטום של התנור, צינורות הפליטה ותעלות האוויר כדי להבטיח שאין דליפות במערכות הבעירה והפליטה. יש לבדוק גם את הגמישות של חלקים מסתובבים ושסתומים.
לאחר ההתקנה, מחוברים צינורות הפליטה, צינורות המאוורר ומערכת קירור המים של המבער, מה שמבטיח אטימה אמינה בממשקים. מערכת החשמל, לרבות ספק הכוח הראשי, ארון הבקרה, החיישנים והתקני האזעקה, חייבת להיות מחווטת בקפדנות בהתאם למפרט החשמל ולהגן בהתאם. לפני הפעלת מערכת הבקרה, בדוק שכל החיישנים והמפעילים פועלים כראוי וודא שהתקני עצירת חירום והגנת הבטיחות אמינים.
לאחר ההתקנה, בצע ריצות בדיקה ללא עומס ועומס מלא. ריצות מבחן ללא עומס בודקות את זרימת האוויר, מערכת הפליטה, מערכת הבקרה וביצועי הבטיחות החשמלית; בדיקת עומס מלא בודקת את יעילות הבעירה, טמפרטורת התנור, פליטת גזי הפליטה ופליטת שאריות. התאם את זרימת האוויר של המפוח, זמן הבעירה ופרמטרים של התקן לטיהור הפליטה בהתבסס על תוצאות ריצת הבדיקה כדי להבטיח שהציוד עומד בדרישות התכנון ובסטנדרטים הסביבתיים.
לאחר ההתקנה וההפעלה, קבע רישומי תפעול ציוד וקבצי התקנה, לרבות דגם ציוד, מידות יסוד, ממשקי צינור, חיבורי חשמל ופרמטרים להפעלה. הדרכת מפעילים לוודא שהם מכירים את תקנות תפעול, תחזוקה ובטיחות של הציוד. ניתן להכניס את הציוד לשימוש רשמי רק לאחר אישור שהשיג את ביצועי התכנון שלו.