שלב התכנון של מגרסת פסולת רפואית קובע את יכולת העיבוד של הציוד, מהירות הגריסה וגודל החלקיקים הפלט בהתאם לגודל המוסד הרפואי וסוגי הפסולת. פרמטרים מרכזיים כמו מספר ראשי החותך, חומר הלהב ומהירות הסיבוב מותאמים בהתאם לסוג הפסולת, ומאפשרים לציוד לעבד ביעילות צורות שונות של פסולת רפואית, לרבות מזרקים, צינורות עירוי, בקבוקי תרופות ופסולת מעבדה, תוך הפחתת נפח לצורך עיקור או שריפה קלה יותר. תא הגריסה עשוי מפלדת אל חלד עמידה בפני קורוזיה עם פנים חלק ונטול פינות לניקוי וחיטוי קלים. יציאות ההזנה והפריקה מתוכננות באופן רציונלי ומצוידות בהתקני הגנה ומנעולי בטיחות כדי למנוע ממפעילים מגע עם הלהבים המסתובבים במהירות גבוהה. למערכת בקרת הציוד פונקציות הגנת עומס יתר וכיבוי חירום, המבטיחות פעולה בטוחה ואמינה גם בעומסים גבוהים ומפחיתה סיכוני טעויות אנוש.
עיצוב המוצר מדגיש את קלות הפירוק וההחלפה של רכיבים מרכזיים, כגון ראש החותך, הלהבים והמיסבים, הניתנים לפירוק מהיר לצורך תחזוקה יומיומית נוחה ותחזוקה תקופתית. גוף המכונה מעוצב בצורה חזקה עם אמצעים טובים לשיכוך רעידות, ולוח הבקרה פשוט ואינטואיטיבי לתפעול, מה שמבטיח שליטה קלה וניהול על ידי המפעילים. התכנון הכולל מאזן בין ביצועים, בטיחות וקלות תחזוקה, ומבטיח פעולה יציבה לטווח ארוך של מגרסת הפסולת הרפואית.